核酸作为基因表达的物质基础，是分子生物学研究的主要对象。无论是进行核酸的结构还是功能研究，都需要对核酸进行提取和纯化，使用裂解液破坏样品细胞结构，从而使样品中的DNA游离在裂解体系中，依诺赞生物需要将与核酸结合的蛋白质以及多糖、脂类等生物大分子和其他不需要的核酸分子去除。

核酸提取为大量广泛研究和应用提供了基础，纯化则是使DNA与裂解体系中的其它成分，如蛋白质、盐及其它杂质彻底分离的过程。染色体DNA比质粒DNA分子大很多，且染色体DNA为线状分子，而质粒DNA为共价闭合环装分子；当加热处理DNA溶液时，线状染色体DNA容易发生变性。

变性染色体DNA片段与变性蛋白质和细胞碎片结合形成沉淀，而复性的超螺旋质粒DNA分子则以溶解状态存在液相中，从而可通过离心将两者分开。DNA提取的经典方法主要是使用两种不同的有机溶剂交替抽提将蛋白去除，用苯酚处理匀浆液时，由于蛋白与DNA的联结键已断。

蛋白分子表面又含有很多极性基团与苯酚相似相溶，同时苯酚抑制了降解作用，蛋白质分子溶于酚相，而DNA溶于水相。离心分层后取出水层，多次重复操作，再合并含DNA的水相，利用核酸不溶于醇的性质，用乙醇沉淀DNA。获得的DNA纯度高、片段大、效果好，但是操作较为繁琐。